PBCV DNA连接酶
描述:
PBCV DNA 连 接 酶 也称为 SplintR 连接酶 或Chorella 病毒 DNA 连接酶,它能够高效催化相邻的 DNA 核苷酸的连接,这个连接过程需要一条互补的 RNA 在两条DNA 单链间起“夹板”或“桥梁”的固定作用。PBCV DNA 连接酶的这种活性远远优于传统的 T4 DNA 连接酶,有助于miRNAs 和 mRNAs,包括 SNPs 在内的研究方法的创新。另外,在二代测序和分子诊断等众多领域中,PBCV DNA连接酶是富集目的基因的理想选择。它具有稳定的生物活性,对 RNA 介导固定的 DNA 底物亲和性强(米氏常数Km = 1 nM),能够在复杂的混合物中检测到亚纳摩尔级的特定 RNA。因此,在 RNA 检测技术中,PBCV DNA 连接酶不失为 选择用酶。
组分
储存:-20℃可保存 3 年。
活性定义:1 单位指 20 μl 反应体系中,1×PBCV 连接酶反应缓冲液,16℃ 条件下,15 分钟内能使 2 pmol 的
DNA:RNA 杂交底物连接反应完成 50%所需的酶量。
应用:
单链 DNA 的连接
基于探针法的 miRNA 的检测
SNP 或剪接体的检测
RASL 分析
反应温度及失活
该酶的 反应温度为 25°C,可在 16-37°C 之间优化,37℃可明 显 提 高反应的特异性;该酶在 65°C 加热 20min 即可失活。
注意事项
1. 1×PBCV Ligation Buffer:50 mM Tris-HCl pH 7.5,5mM MgCl2,0.1mM ATP, 10 mM DTT。
2. 该酶对 ATP 的要求比较宽泛,10-100 μM ATP 范围内都可发挥活性,5 mM Mg2+可显著增加连接产物的量, pH为 7.5-8.0。
3. 该酶对一价阳离子非常敏感,如 NaCl 或 KCl 的浓度应低于 50 mM,100 mM 的 NaCl 会完全抑制连接反应。
4. 该酶的反应温度为16~37°C,随着温度的上升酶活性会提高,但此时腺苷化产物也随之增加, 温度为25℃。
5. 连接效率随着夹板 RNA 长度的减少而降低,当长度小于等于 10nt 时,连接效率为零。
6. 供体的 5’端 个碱基为“A/T”时连接效率 。
7. 受体的 3’端 个碱基为“T”时连接效率 ,3’端
个碱基为“G”时连接效率最差。
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